オキナワオオコウモリ学名：Pteropus loochoensis
哺乳類 絶滅（EX）
ミヤココキクガシラコウモリ学名：Rhinolophus pumilus miyakonis
哺乳類 絶滅（EX）
オガサワラアブラコウモリ学名：Pipistrellus sturdeei
哺乳類 絶滅（EX）
エゾオオカミ学名：Canis lupus hattai
哺乳類 絶滅（EX）
ニホンオオカミ学名：Canis lupus hodophilax
哺乳類 絶滅（EX）
ニホンカワウソ（本州以南亜種）学名：Lutra lutra nippon
哺乳類 絶滅（EX）
ニホンカワウソ（北海道亜種）学名：Lutra lutra whiteleyi
哺乳類 絶滅（EX）
センカクモグラ学名：Mogera uchidai
哺乳類 絶滅危惧IA類（CR）
ダイトウオオコウモリ学名：Pteropus dasymallus daitoensis
哺乳類 絶滅危惧IA類（CR）
エラブオオコウモリ学名：Pteropus dasymallus dasymallus
哺乳類 絶滅危惧IA類（CR）
クロアカコウモリ学名：Myotis formosus
哺乳類 絶滅危惧IA類（CR）
ヤンバルホオヒゲコウモリ学名：Myotis yanbarensis
哺乳類 絶滅危惧IA類（CR）
オキナワトゲネズミ学名：Tokudaia muenninki
哺乳類 絶滅危惧IA類（CR）
セスジネズミ学名：Apodemus agrarius
哺乳類 絶滅危惧IA類（CR）
ツシマヤマネコ学名：Prionailurus bengalensis euptilurus
哺乳類 絶滅危惧IA類（CR）
イリオモテヤマネコ学名：Prionailurus bengalensis iriomotensis
哺乳類 絶滅危惧IA類（CR）
ラッコ学名：Enhydra lutris
哺乳類 絶滅危惧IA類（CR）
ニホンアシカ学名：Zalophus japonicus
哺乳類 絶滅危惧IA類（CR）
ジュゴン学名：Dugong dugon
哺乳類 絶滅危惧IA類（CR）
オリイジネズミ学名：Crocidura orii
哺乳類 絶滅危惧TB類（EN）
エチゴモグラ学名：Mogera etigo
哺乳類 絶滅危惧TB類（EN）
オガサワラオオコウモリ学名：Pteropus pselaphon
哺乳類 絶滅危惧TB類（EN）
オリイコキクガシラコウモリ学名：Rhinolophus cornutus orii
哺乳類 絶滅危惧TB類（EN）
オキナワコキクガシラコウモリ学名：Rhinolophus pumilus pumilus
哺乳類 絶滅危惧TB類（EN）
コヤマコウモリ学名：Nyctalus furvus
哺乳類 絶滅危惧TB類（EN）
リュウキュウユビナガコウモリ学名：Miniopterus fuscus
哺乳類 絶滅危惧TB類（EN）
リュウキュウテングコウモリ学名：Murina ryukyuana
哺乳類 絶滅危惧TB類（EN）
アマミトゲネズミ学名：Tokudaia osimensis
哺乳類 絶滅危惧TB類（EN）
トクノシマトゲネズミ学名：Tokudaia tokunoshimensis
哺乳類 絶滅危惧TB類（EN）
ケナガネズミ学名：Diplothrix legata
哺乳類 絶滅危惧TB類（EN）
アマミノクロウサギ学名：Pentalagus furnessi
哺乳類 絶滅危惧TB類（EN）
トウキョウトガリネズミ学名：Sorex minutissimus hawkeri
哺乳類 絶滅危惧II類（VU）
ヤエヤマコキクガシラコウモリ学名：Rhinolophus perditus
哺乳類 絶滅危惧II類（VU）
クビワコウモリ学名：Eptesicus japonensis
哺乳類 絶滅危惧II類（VU）
ヤマコウモリ学名：Nyctalus aviator
哺乳類 絶滅危惧II類（VU）
モリアブラコウモリ学名：Pipistrellus endoi
哺乳類 絶滅危惧II類（VU）
ウスリホオヒゲコウモリ学名：Myotis gracilis
哺乳類 絶滅危惧II類（VU）
ホンドノレンコウモリ学名：Myotis nattereri bombinus
哺乳類 絶滅危惧II類（VU）
クロホオヒゲコウモリ学名：Myotis pruinosus
哺乳類 絶滅危惧II類（VU）
オヒキコウモリ学名：Tadarida insignis
哺乳類 絶滅危惧II類（VU）
ゼニガタアザラシ学名：Phoca vitulina
哺乳類 絶滅危惧II類（VU）
アズミトガリネズミ学名：Sorex hosonoi
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
シコクトガリネズミ学名：Sorex shinto shikokensis
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
コジネズミ学名：Crocidura shantungensis
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
ワタセジネズミ学名：Crocidura watasei
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
ミズラモグラ学名：Euroscaptor mizura
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
サドモグラ学名：Mogera tokudae
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
ミヤマムクゲネズミ学名：Myodes rex montanus
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
リシリムクゲネズミ学名：Myodes rex rex
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
エゾナキウサギ学名：Ochotona hyperborea yesoensis
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
サドノウサギ学名：Lepus brachyurus lyoni
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
チョウセンイタチ学名：Mustela sibirica coreana
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
ニホンイイズナ（本州亜種）学名：Mustela nivalis namiyei
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
ホンドオコジョ学名：Mustela erminea nippon
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
エゾオコジョ学名：Mustela erminea orientalis
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
ツシマテン学名：Martes melampus tsuensis
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
エゾクロテン学名：Martes zibellina brachyura
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
トド学名：Eumetopias jubatus
哺乳類 準絶滅危惧（NT）
オオアブラコウモリ学名：Hypsugo alaschanicus
哺乳類 情報不足（DD）
ヒメヒナコウモリ学名：Vespertilio murinus
哺乳類 情報不足（DD）
クチバテングコウモリ学名：Murina tenebrosa
哺乳類 情報不足（DD）
スミイロオヒキコウモリ学名：Tadarida latouchei
哺乳類 情報不足（DD）
エゾシマリス学名：Tamias sibiricus lineatus
哺乳類 情報不足（DD）
九州地方のカワネズミ学名：Chimarrogale platycephala
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
与那国島のカグラコウモリ学名：Hipposideros turpis
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
波照間島のカグラコウモリ学名：Hipposideros turpis
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
本州のチチブコウモリ学名：Barbastella leucomelas
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
四国のチチブコウモリ学名：Barbastella leucomelas
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
近畿地方以西のウサギコウモリ学名：Plecotus sacrimontis
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
紀伊半島のシナノホオヒゲコウモリ学名：Myotis ikonnikovi hosonoi
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
中国地方のシナノホオヒゲコウモリ学名：Myotis ikonnikovi hosonoi
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
北奥羽・北上山系のホンドザル学名：Macaca fuscata fuscata
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
金華山のホンドザル学名：Macaca fuscata fuscata
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
中国地方のニホンリス学名：Sciurus lis
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
九州地方のニホンリス学名：Sciurus lis
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
天塩・増毛地方のエゾヒグマ学名：Ursus arctos yezoensis
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
石狩西部のエゾヒグマ学名：Ursus arctos yezoensis
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
下北半島のツキノワグマ学名：Ursus thibetanus japonicus
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
紀伊半島のツキノワグマ学名：Ursus thibetanus japonicus
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
東中国地域のツキノワグマ学名：Ursus thibetanus japonicus
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
西中国地域のツキノワグマ学名：Ursus thibetanus japonicus
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
四国山地のツキノワグマ学名：Ursus thibetanus japonicus
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
馬毛島のニホンジカ学名：Cervus nippon
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
徳之島のリュウキュウイノシシ学名：Sus scrofa riukiuanus
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
九州地方のカモシカ学名：Capricornis crispus
哺乳類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
ハシブトゴイ学名：Nycticorax caledonicus crassirostris
鳥類 絶滅（EX）
カンムリツクシガモ学名：Tadorna cristata
鳥類 絶滅（EX）
ダイトウノスリ学名：Buteo buteo oshiroi
鳥類 絶滅（EX）
マミジロクイナ学名：Poliolimnas cinereus brevipes
鳥類 絶滅（EX）
リュウキュウカラスバト学名：Columba jouyi
鳥類 絶滅（EX）
オガサワラカラスバト学名：Columba versicolor
鳥類 絶滅（EX）
ミヤコショウビン学名：Halcyon miyakoensis
鳥類 絶滅（EX）
キタタキ学名：Dryocopus javensis richardsi
鳥類 絶滅（EX）
ダイトウミソサザイ学名：Troglodytes troglodytes orii
鳥類 絶滅（EX）
オガサワラガビチョウ学名：Cichlopasser terrestris
鳥類 絶滅（EX）
ダイトウウグイス学名：Cettia diphone restricta
鳥類 絶滅（EX）
ダイトウヤマガラ学名：Parus varius orii
鳥類 絶滅（EX）
ムコジマメグロ学名：Apalopteron familiare familiare
鳥類 絶滅（EX）
オガサワラマシコ学名：Chaunoproctus ferreorostris
鳥類 絶滅（EX）
トキ学名：Nipponia nippon
鳥類 野生絶滅（EW）
オガサワラヒメミズナギドリ学名：Puffinus bryani
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
クロコシジロウミツバメ学名：Oceanodroma castro
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
チシマウガラス学名：Phalacrocorax urile
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
オオヨシゴイ学名：Ixobrychus eurhythmus
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
コウノトリ学名：Ciconia boyciana
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
シジュウカラガン学名：Branta canadensis leucopareia
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
ハクガン学名：Anser caerulescens caerulescens
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
カンムリワシ学名：Spilornis cheela perplexus
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
ヤンバルクイナ学名：Gallirallus okinawae
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
ヘラシギ学名：Eurynorhynchus pygmeus
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
カラフトアオアシシギ学名：Tringa guttifer
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
ウミガラス学名：Uria aalge inornata
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
ウミスズメ学名：Synthliboramphus antiquus
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
エトピリカ学名：Lunda cirrhata
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
アカガシラカラスバト学名：Columba janthina nitens
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
ワシミミズク学名：Bubo bubo
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
シマフクロウ学名：Ketupa blakistoni blakistoni
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
キンメフクロウ学名：Aegolius funereus magnus
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
ノグチゲラ学名：Sapheopipo noguchii
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
ミユビゲラ学名：Picoides tridactylus inouyei
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
チゴモズ学名：Lanius tigrinus
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
シマアオジ学名：Emberiza aureola ornata
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
オガサワラカワラヒワ学名：Carduelis sinica kittlitzi
鳥類 絶滅危惧IA類（CR）
コアホウドリ学名：Diomedea immutabilis
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
セグロミズナギドリ学名：Puffinus lherminieri bannermani
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
アカオネッタイチョウ学名：Phaethon rubricauda rothschildi
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
アカアシカツオドリ学名：Sula sula rubripes
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
ヒメウ学名：Phalacrocorax pelagicus pelagicus
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
サンカノゴイ学名：Botaurus stellaris stellaris
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
クロツラヘラサギ学名：Platalea minor
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
カリガネ学名：Anser erythropus
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
リュウキュウツミ学名：Accipiter gularis iwasakii
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
オガサワラノスリ学名：Buteo buteo toyoshimai
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
クマタカ学名：Spizaetus nipalensis orientalis
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
イヌワシ学名：Aquila chrysaetos japonica
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
チュウヒ学名：Circus spilonotus spilonotus
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
ライチョウ学名：Lagopus mutus japonicus
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
オオクイナ学名：Rallina eurizonoides sepiaria
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
シマクイナ学名：Coturnicops noveboracensis exquisitus
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
コシャクシギ学名：Numenius minutus
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
ヨナクニカラスバト学名：Columba janthina stejnegeri
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
シラコバト学名：Streptopelia decaocto decaocto
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
キンバト学名：Chalcophaps indica yamashinai
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
ブッポウソウ学名：Eurystomus orientalis calonyx
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
ヤイロチョウ学名：Pitta brachyura nympha
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
アカモズ学名：Lanius cristatus superciliosus
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
モスケミソサザイ学名：Troglodytes troglodytes mosukei
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
ホントウアカヒゲ学名：Erithacus komadori namiyei
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
アカコッコ学名：Turdus celaenops
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
オオセッカ学名：Locustella pryeri pryeri
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
ウチヤマセンニュウ学名：Locustella pleskei
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
ナミエヤマガラ学名：Parus varius namiyei
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
オーストンヤマガラ学名：Parus varius owstoni
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
ハハジマメグロ学名：Apalopteron familiare hahasima
鳥類 絶滅危惧TB類（EN）
アホウドリ学名：Diomedea albatrus
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ヒメクロウミツバメ学名：Oceanodroma monorhis
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ミゾゴイ学名：Gorsachius goisagi
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ズグロミゾゴイ学名：Gorsachius melanolophus
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
コクガン学名：Branta bernicla orientalis
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ヒシクイ学名：Anser fabalis serrirostris
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ツクシガモ学名：Tadorna tadorna
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
トモエガモ学名：Anas formosa
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
オジロワシ学名：Haliaeetus albicilla albicilla
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
オオワシ学名：Haliaeetus pelagicus pelagicus
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
サシバ学名：Butastur indicus
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ハヤブサ学名：Falco peregrinus japonensis
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ウズラ学名：Coturnix japonica
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
タンチョウ学名：Grus japonensis
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ナベヅル学名：Grus monacha
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
マナヅル学名：Grus vipio
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
タマシギ学名：Rostratula benghalensis benghalensis
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
シロチドリ学名：Charadrius alexandrinus
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ツルシギ学名：Tringa erythropus
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
アカアシシギ学名：Tringa totanus ussuriensis
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
タカブシギ学名：Tringa glareola
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
オオソリハシシギ学名：Limosa lapponica
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ホウロクシギ学名：Numenius madagascariensis
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
アマミヤマシギ学名：Scolopax mira
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
セイタカシギ学名：Himantopus himantopus himantopus
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ツバメチドリ学名：Glareola maldivarum
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ズグロカモメ学名：Larus saundersi
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
オオアジサシ学名：Thalasseus bergii cristatus
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ベニアジサシ学名：Sterna dougallii bangsi
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
エリグロアジサシ学名：Sterna sumatrana
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
コアジサシ学名：Sterna albifrons sinensis
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ケイマフリ学名：Cepphus carbo
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
カンムリウミスズメ学名：Synthliboramphus wumizusume
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
ダイトウコノハズク学名：Otus elegans interpositus
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
リュウキュウオオコノハズク学名：Otus lempiji pryeri
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
クマゲラ学名：Dryocopus martius martius
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
オーストンオオアカゲラ学名：Dendrocopos leucotos owstoni
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
サンショウクイ学名：Pericrocotus divaricatus divaricatus
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
タネコマドリ学名：Erithacus akahige tanensis
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
アカヒゲ学名：Erithacus komadori komadori
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
オオトラツグミ学名：Zoothera dauma major
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
イイジマムシクイ学名：Phylloscopus ijimae
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
コジュリン学名：Emberiza yessoensis yessoensis
鳥類 絶滅危惧II類（VU）
オーストンウミツバメ学名：Oceanodroma tristrami
鳥類 準絶滅危惧（NT）
クロウミツバメ学名：Oceanodroma matsudairae
鳥類 準絶滅危惧（NT）
ヨシゴイ学名：Ixobrychus sinensis sinensis
鳥類 準絶滅危惧（NT）
チュウサギ学名：Egretta intermedia intermedia
鳥類 準絶滅危惧（NT）
カラシラサギ学名：Egretta eulophotes
鳥類 準絶滅危惧（NT）
マガン学名：Anser albifrons frontalis
鳥類 準絶滅危惧（NT）
オオヒシクイ学名：Anser fabalis middendorffii
鳥類 準絶滅危惧（NT）
ミサゴ学名：Pandion haliaetus haliaetus
鳥類 準絶滅危惧（NT）
ハチクマ学名：Pernis apivorus orientalis
鳥類 準絶滅危惧（NT）
オオタカ学名：Accipiter gentilis fujiyamae
鳥類 準絶滅危惧（NT）
ハイタカ学名：Accipiter nisus nisosimilis
鳥類 準絶滅危惧（NT）
アカヤマドリ学名：Syrmaticus soemmerringii soemmerringii
鳥類 準絶滅危惧（NT）
コシジロヤマドリ学名：Syrmaticus soemmerringii ijimae
鳥類 準絶滅危惧（NT）
ヒクイナ学名：Porzana fusca erythrothorax
鳥類 準絶滅危惧（NT）
ハマシギ学名：Calidris alpina
鳥類 準絶滅危惧（NT）
オオジシギ学名：Gallinago hardwickii
鳥類 準絶滅危惧（NT）
カラスバト学名：Columba janthina janthina
鳥類 準絶滅危惧（NT）
ヨタカ学名：Caprimulgus indicus jotaka
鳥類 準絶滅危惧（NT）
マキノセンニュウ学名：Locustella lanceolata
鳥類 準絶滅危惧（NT）
オリイヤマガラ学名：Parus varius olivaceus
鳥類 準絶滅危惧（NT）
ノジコ学名：Emberiza sulphurata
鳥類 準絶滅危惧（NT）
シロハラミズナギドリ学名：Pterodroma hypoleuca
鳥類 情報不足（DD）
ヘラサギ学名：Platalea leucorodia major
鳥類 情報不足（DD）
クロトキ学名：Threskiornis melanocephalus
鳥類 情報不足（DD）
サカツラガン学名：Anser cygnoides
鳥類 情報不足（DD）
アカツクシガモ学名：Tadorna ferruginea
鳥類 情報不足（DD）
オシドリ学名：Aix galericulata
鳥類 情報不足（DD）
アカハジロ学名：Aythya baeri
鳥類 情報不足（DD）
シマハヤブサ学名：Falco peregrinus furuitii
鳥類 情報不足（DD）
エゾライチョウ学名：Tetrastes bonasia vicinitas
鳥類 情報不足（DD）
クロヅル学名：Grus grus lilfordi
鳥類 情報不足（DD）
ケリ学名：Vanellus cinereus
鳥類 情報不足（DD）
チシマシギ学名：Calidris ptilocnemis kurilensis
鳥類 情報不足（DD）
シベリアオオハシシギ学名：Limnodromus semipalmatus
鳥類 情報不足（DD）
マダラウミスズメ学名：Brachyramphus marmoratus perdix
鳥類 情報不足（DD）
ウスアカヒゲ学名：Erithacus komadori subrufus
鳥類 情報不足（DD）
コトラツグミ学名：Zoothera dauma horsfieldi
鳥類 情報不足（DD）
ウグイスの1亜種学名：Cettia diphone ssp.
鳥類 情報不足（DD）
青森県のカンムリカイツブリ繁殖個体群学名：Podiceps cristatus cristatus
鳥類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
東北地方以北のシノリガモ繁殖個体群学名：Histrionicus histrionicus pacificus
鳥類 絶滅のおそれのある地域個体群（LP）
イヘヤトカゲモドキ学名：Goniurosaurus kuroiwae toyamai
爬虫類 絶滅危惧IA類（CR）
クメトカゲモドキ学名：Goniurosaurus kuroiwae yamashinae
爬虫類 絶滅危惧IA類（CR）
ミヤコカナヘビ学名：Takydromus toyamai
爬虫類 絶滅危惧IA類（CR）
キクザトサワヘビ学名：Opisthotropis kikuzatoi
爬虫類 絶滅危惧IA類（CR）
アカウミガメ学名：Caretta caretta
爬虫類 絶滅危惧TB類（EN）
タイマイ学名：Eretmochelys imbricata
爬虫類 絶滅危惧TB類（EN）
オビトカゲモドキ学名：Goniurosaurus kuroiwae splendens
爬虫類 絶滅危惧TB類（EN）
マダラトカゲモドキ学名：Goniurosaurus kuroiwae orientalis
爬虫類 絶滅危惧TB類（EN）
アオスジトカゲ学名：Plestiodon elegans
爬虫類 絶滅危惧TB類（EN）
シュウダ学名：Elaphe carinata carinata
爬虫類 絶滅危惧TB類（EN）
ヨナグニシュウダ学名：Elaphe carinata yonaguniensis
爬虫類 絶滅危惧TB類（EN）
ミヤコヒバァ学名：Amphiesma concelarum
爬虫類 絶滅危惧TB類（EN）
ミヤコヒメヘビ学名：Calamaria pfefferi
爬虫類 絶滅危惧TB類（EN）